由于气调库的建筑、设备的特殊性，气调库的安全管理也是十分重要的工作。
1.库房围护结构的安全管理
气调库是一种对气密性有特殊要求的建筑物，库内外温度的变化，以及在气调设备的运行中，都可能引起库房围护结构两侧压差变化。压差值超过一定的限度，就会破坏围护结构，这点不可因气调库设置了安全阀和调气袋就可以掉以轻心。
2.人身安全管理
要求气调库的操作、管理人员一定要掌握安全知识。气调库内气体不能维持认得生命，不可像一出入冷藏库那样贸然进入气调库，必须熟练掌握呼吸装置的使用。
为了保证人身安全，必须制定下管理措施，以防止发生人身伤亡事故。
①在每扇气调库的气密门上，书写醒目的危险标志如：“危险--库内缺氧，未带氧气罩者禁止入内！”封门后，气密门及其小门应加锁，防止闲杂人员误入。
②需进入气调库维修设备或检查贮藏质量时，需两人同行，均戴好呼吸装置后，一人入库，一人在窗外观察，严禁两人同时入库作业
③至少要准备两套完好的呼吸装置，并定期检查其可靠性
④经常开展安全教育，使所有的操作管理人员树立强烈的安全意识。
